Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms