Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN19Q8N6F1 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms