Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
OTOP1Q7RTM1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms