Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VSTM1Q6UX27 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms