Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NTRK2Q16620 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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