Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCSK7Q16549 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms