Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms