Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TAF1AQ15573 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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