Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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ITGA9Q13797 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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ITGA9Q13797 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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ITGA9Q13797 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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ITGA9Q13797 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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ITGA9Q13797 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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ITGA9Q13797 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA9Q13797 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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