Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms