Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PPP1R1AQ13522 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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