Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCOF1Q13428 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCOF1Q13428 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
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