Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCGQ13326 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms