Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTK7Q13308 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms