Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms