Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
STX4Q12846 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
STX4Q12846 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
STX4Q12846 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms