Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms