Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms