Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms