Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DEUP1Q05D60 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms