Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms