Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms