Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GSCP56915 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GSCP56915 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSCP56915 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSCP56915 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSCP56915 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSCP56915 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSCP56915 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSCP56915 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSCP56915 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSCP56915 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSCP56915 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSCP56915 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSCP56915 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSCP56915 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GSCP56915 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms