Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BACE1P56817 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BACE1P56817 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms