Protein–RNA interactions for Protein: P56747

CLDN6, Claudin-6, humanhuman

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN6P56747 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN6P56747 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN6P56747 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN6P56747 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN6P56747 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN6P56747 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN6P56747 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN6P56747 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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CLDN6P56747 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN6P56747 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN6P56747 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN6P56747 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN6P56747 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN6P56747 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN6P56747 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN6P56747 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN6P56747 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN6P56747 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN6P56747 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN6P56747 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN6P56747 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN6P56747 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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