Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ZNF135P52742 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF135P52742 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms