Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms