Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PBX2P40425 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PBX2P40425 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBX2P40425 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBX2P40425 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBX2P40425 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBX2P40425 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBX2P40425 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBX2P40425 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBX2P40425 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBX2P40425 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBX2P40425 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBX2P40425 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBX2P40425 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBX2P40425 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PBX2P40425 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PBX2P40425 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms