Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms