Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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CASQ1P31415 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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CASQ1P31415 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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CASQ1P31415 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CASQ1P31415 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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