Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CD40LGP29965 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CD40LGP29965 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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