Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MMP11P24347 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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MMP11P24347 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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MMP11P24347 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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MMP11P24347 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP11P24347 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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