Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CREB1P16220 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CREB1P16220 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms