Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP3O14828 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms