Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms