Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms