Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP20Q9Y2K6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms