Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PPARGC1AQ9UBK2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPARGC1AQ9UBK2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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