Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CCDC88CQ9P219 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CCDC88CQ9P219 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CCDC88CQ9P219 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CCDC88CQ9P219 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CCDC88CQ9P219 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CCDC88CQ9P219 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CCDC88CQ9P219 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CCDC88CQ9P219 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCDC88CQ9P219 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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