Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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