Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX15Q9NRS6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms