Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TIMMDC1Q9NPL8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TIMMDC1Q9NPL8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TIMMDC1Q9NPL8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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