Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM4Q9C037 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms