Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP1Q9C000 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms