Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445675.1-201ENST00000603868 1410 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF839P1-201ENST00000403487 861 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYNC2LI1-204ENST00000406852 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073188.3-201ENST00000425228 339 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL137220.1-201ENST00000431369 661 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 GBP1P1-202ENST00000513638 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02445-201ENST00000551387 459 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00566-201ENST00000561557 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF569-205ENST00000589833 762 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 Metazoa_SRP.60-201ENST00000616888 305 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms