Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF548Q8NEK5 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF548Q8NEK5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF548Q8NEK5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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