Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS8Q8N3P4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS8Q8N3P4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms