Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM46CQ5VWP2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms