Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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