Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL24A1Q17RW2 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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